Высота над уровнем моря составляет 106 метров, а площадь — 200 квадратных километра. Средняя глубина — 1,4 метра. В озеро впадает река Чулым, которая берёт своё начало в Васюганских болотах.
Водоём расположен в лесостепной природной зоне. Здесь обитает 20 видов растений и животных, внесённых в Красную книгу России.
Озеро Малые Чаны соединяется протоком Кожурла с более крупным и солёным озером Чаны.
В 2005 году на территории водоёма был зафиксирован очаг эпизоотии (широкомасштабное распространение инфекционной болезни) птичьего гриппа.
Новосибирская область, Россия