Раньше, на месте церкви было обычное село Зюзино, которое принадлежало князьям Прозоровским. В конце XVII века барин закомандовал выстроить на территории своей земли церковь. Деревянный храм во имя благоверного Владимира выстроился в считанные месяцы. Чуть позже одного здания для церкви показалось мало, и в 1704 году к ней пристроили из белого кирпича корпус в стиле московского барокко, который нарекли в честь благоверных Бориса и Глеба. Название прижилось ко всей обители.
В период СССР, в 1938 году храм закрыли. В 50-х годах прошлого века церковь отремонтировали и отдали под мастерскую по обработке алмазов. Ювелиры находились там до 1979 года, когда здание решили снова ремонтировать. По окончанию реконструкции там расположился архив Министерства промышленности СССР. Здание вернули церкви через 10 лет.
На сегодняшний день церковь является действующей. Ее двери всегда открыты для прихожан.
улица Перекопская, 7, район Зюзино, город Москва
