Церковь Св. Саргис, как и весь монастырский комплекс, полностью была разрушена во время землетрясения в 1679 году и заново восстановлена на том же месте в годы правления Католикоса Наапета Едесаци (1691-1705гг.). Нынешняя церковь Св. Саргис была построена заново в 1835-1842 годах. По своему архитектурному решению церковь была самой неприглядной среди церквей Еревана. Ее внешний вид и внутреннее убранство не соответствовали ее назначению- как Викариальной церкови Араратской Патриаршеской епархии. В годы правления Католикоса Всех Армян Вазгена Первого церковь была полностью реконструирована и отреставрирована.
